RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556343.1

ACTN1-218, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 3

Gene ACTN1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-218ENST00000556343 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 ING5Q8WYH8 240 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 TSC1Q92574 1164 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 SMARCD2Q92925 531 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 CARD6Q9BX69 1037 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.51□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 S1PR5Q9H228 398 aa9.51□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 CHRNA3P32297 505 aa9.5□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 DYNLT1P63172 113 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 MMRN1Q13201 1228 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 SEMA3BQ13214 749 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 XRCC4Q13426 336 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 COL19A1Q14993 1142 aa9.5□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 SLC9A4Q6AI14 798 aa9.5□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 MTSS1LQ765P7 747 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.5□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 SLC22A12Q96S37 553 aa9.5□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.5□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa9.49□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 H7C0C1 242 aa9.49□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 ETFBP38117 255 aa9.49□□□□□ -0.89
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ACTN1-218ENST00000556343 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 LLGL1Q15334 1064 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 C5orf22Q49AR2 442 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 MPP7Q5T2T1 576 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 STXBP5Q5T5C0 1151 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 C6orf118Q5T5N4 469 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 MANEALQ5VSG8 457 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 AADACL2Q6P093 401 aa9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ACTN1-218ENST00000556343 C1orf228Q6PIY5 440 aa9.49□□□□□ -0.89
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