RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ZBTB22O15209 634 aa8.26□□□□□ -1.09
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PTPRB-209ENST00000550857 NT5MQ9NPB1 228 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRB-209ENST00000550857 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.25□□□□□ -1.09
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