RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 TPGS1Q6ZTW0 290 aa23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 E9PAM4 449 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA3BQ13214 749 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRF1Q5T601 910 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 OSBPL2Q9H1P3 480 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 E2F8A0AVK6 867 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 NUMBP49757 651 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 AIF1P55008 147 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF683Q8IZ20 524 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 EXD1Q8NHP7 514 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 BPIFB1Q8TDL5 484 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DCLK3Q9C098 648 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PLK2Q9NYY3 685 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 CNTN5O94779 1100 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 AMPD1P23109 780 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 WEE1P30291 646 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 RCOR2Q8IZ40 523 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 CSPG4P5Q96PW8 444 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 NEU3Q9UQ49 428 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP104O60308 925 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 EPHB2P29323 1055 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 CDKN2BP42772 138 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DYNLT1P63172 113 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ALFQ53S48 1182 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TSC1Q92574 1164 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 C1orf74Q96LT6 269 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 STIM2Q9P246 746 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ARSAP15289 507 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TPI1P60174 286 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 AMPD2Q01433 879 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TNK2Q07912 1038 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 RFX8Q6ZV50 586 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM25Q86YD3 366 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDH19Q8TAB3 1148 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC8Q8TAM2 541 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 VCANP13611 3396 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 F5H5T6 163 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 MANEALQ5VSG8 457 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM71BQ8TC56 605 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 AZIN2Q96A70 460 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 EPAS1Q99814 870 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 EBF3Q9H4W6 596 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 STOML2Q9UJZ1 356 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DOCK8Q8NF50 2099 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 DAPK3O43293 454 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP3K6O95382 1288 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ASGR2P07307 311 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ARL4AP40617 200 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PDK2Q15119 407 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 RFX6Q8HWS3 928 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 PQLC3Q8N755 202 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 NDFIP2Q9NV92 336 aa23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 HTR4Q13639 388 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 MAP7D3Q8IWC1 876 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 HAUS1Q96CS2 278 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM118BQ9BPY3 351 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 CARD9Q9H257 536 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BRJ5 948 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TCF3P15923 654 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DPYSQ14117 519 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-208ENST00000524325 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms