RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 CPQQ9Y646 472 aa8.71□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 C19orf81C9J6K1 198 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CAPNS1P04632 268 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PSAPP07602 524 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MYL2P10916 166 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PRKCAP17252 672 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 IL4RP24394 825 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 ACTR2P61160 394 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 CAV1Q03135 178 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 PEX13Q92968 403 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 ATP2A3Q93084 1043 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa8.7□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 103.4
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TRPS1-209ENST00000519674 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 C7orf26Q96N11 449 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.7□□□□□ -1.02
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TRPS1-209ENST00000519674 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 AP3B1O00203 1094 aa8.69□□□□□ -1.02
TRPS1-209ENST00000519674 MYO1DO94832 1006 aa8.69□□□□□ -1.02
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