RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 E7ESA3 106 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 NFIBO00712 420 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 KLF11O14901 512 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB39O15060 712 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC22O60826 627 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 TJP3O95049 919 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 LSM8O95777 96 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF806P0C7X5 589 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 VSIG8P0DPA2 414 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 RALAP11233 206 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 PHBP35232 272 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 PSMC5P62195 406 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 GSTA3Q16772 222 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 FYB2Q5VWT5 728 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ANO7Q6IWH7 933 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 CENPUQ71F23 418 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 OTUD6AQ7L8S5 288 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MFN1Q8IWA4 741 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 NIPA2Q8N8Q9 360 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 DEFB124Q8NES8 71 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 GDAP1Q8TB36 358 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ERP27Q96DN0 273 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 ASB3Q9Y575 518 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 STYXL1Q9Y6J8 313 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 NUMBLQ9Y6R0 609 aa7.47□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.46□□□□□ -1.21
SMIM20-202ENST00000514384 TTC3P53804 2025 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 LRRD1A4D1F6 860 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 A8MUI8 341 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 A8MXQ7 604 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 F8W8V4 182 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CHMP2AO43633 222 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SPAG6O75602 509 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CFBP00751 764 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 PIGRP01833 764 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ICAM1P05362 532 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 LINGO3P0C6S8 592 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 NEFHP12036 1026 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ITGB5P18084 799 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CD52P31358 61 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 VHLP40337 213 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CLCN2P51788 898 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 RAP1GDS1P52306 607 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 NOMO3P69849 1222 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 KRT76Q01546 638 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 KLC1Q07866 573 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 MAMLD1Q13495 774 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SNX1Q13596 522 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 PSMD6Q15008 389 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TMED2Q15363 201 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TAZQ16635 292 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 DBN1Q16643 649 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 P3H1Q32P28 736 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TKFCQ3LXA3 575 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ZACNQ401N2 412 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SLC44A4Q53GD3 710 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.46□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 LCE2CQ5TA81 110 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms