RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 BICDL2A1A5D9 508 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 IRAK2O43187 625 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 FBXO21O94952 628 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 FYNP06241 537 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 BNC1Q01954 994 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 KCNH2Q12809 1159 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 ZNF423Q2M1K9 1284 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 MFN1Q8IWA4 741 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 SCUBE3Q8IX30 993 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 GAREM1Q9H706 876 aa17.58■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa17.58■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 RPS24P62847 133 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 FOXR2Q6PJQ5 311 aa17.57■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 CER1O95813 267 aa17.56■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 DNTTP04053 509 aa17.56■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 IL27RAQ6UWB1 636 aa17.56■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 FIBINQ8TAL6 211 aa17.56■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.56■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP17.56■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 FAM221BA6H8Z2 402 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 CBFA2T3O75081 653 aa17.55■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 GNA14O95837 355 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 AFPP02771 609 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 ZNF883P0CG24 379 aa17.55■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 MS4A13Q5J8X5 152 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 SYPL2Q5VXT5 272 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 CFAP52Q8N1V2 620 aa17.55■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 TTC17Q96AE7 1141 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 BIRC7Q96CA5 298 aa17.55■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
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HERC3-211ENST00000513325 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 CNTN6Q9UQ52 1028 aa17.55■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 NUMA1Q14980 2115 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 SART1O43290 800 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 FSBPO95073 299 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 MARSP56192 900 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 ST8SIA6P61647 398 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 PAK1Q13153 545 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 NNTQ13423 1086 aa17.54■□□□□ 0.4
HERC3-211ENST00000513325 CDH18Q13634 790 aa17.54■□□□□ 0.4
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