RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511392.5

CDV3-208, Transcript of CDV3 homolog, human

TSL 5 BASIC

Gene CDV3, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDV3-208	ENST00000511392	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ZACN	Q401N2	412 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	HLA-DQA1	Q5Y7H0	255 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	OSTM1	Q86WC4	334 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SUSD6	Q92537	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GULP1	Q9UBP9	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	COG5	Q9UP83	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FRYL	O94915	3013 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	C7orf72	A4D263	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	IKBKB	O14920	756 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MBTPS2	O43462	519 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	NCK2	O43639	380 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	NPHS1	O60500	1241 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ABLIM3	O94929	683 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KIF20A	O95235	890 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SEC24A	O95486	1093 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GLUD1	P00367	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TNNC2	P02585	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ODC1	P11926	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	IL9	P15248	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PAX3	P23760	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ARL4A	P40617	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	BCL6	P41182	706 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PNPLA4	P41247	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GCLM	P48507	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	VAMP7	P51809	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	STX17	P56962	302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	MYL6	P60660	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GABRE	P78334	506 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	RBP5	P82980	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CREM	Q03060	361 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	PAK1	Q13153	545 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ADAM9	Q13443	819 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SURF1	Q15526	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CLUL1	Q15846	466 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDV3-208	ENST00000511392	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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