RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 GPC5P78333 572 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 DLGAP5Q15398 846 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 TBRG1Q3YBR2 411 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC24Q50LG9 513 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ACSM6Q6P461 480 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 C16orf89Q6UX73 402 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 FSIP1Q8NA03 581 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 NPIPB3Q92617 1050 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 RMI1Q9H9A7 625 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 NOD2Q9HC29 1040 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 SH3BP4Q9P0V3 963 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 CRYL1Q9Y2S2 319 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 DERAQ9Y315 318 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 DEPDC5O75140 1603 aa4.85□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 EP400Q96L91 3159 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 CNTLNQ9NXG0 1405 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 STX16O14662 325 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 FYB1O15117 783 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 NKX2-8O15522 239 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 GCATO75600 419 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 TJP3O95049 919 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 DRD4P21917 467 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 PCP4P48539 62 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 CYP4F2P78329 520 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 UBE3AQ05086 875 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 FAM187BQ17R55 369 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 WDR93Q6P2C0 686 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM65Q6PI78 240 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 OR4N4Q8N0Y3 316 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 Q8N1X5 172 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 TERB1Q8NA31 727 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ASB12Q8WXK4 309 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 SLC9A6Q92581 669 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 STAMQ92783 540 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 GGA3Q9NZ52 723 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.84□□□□□ -1.63
POLR1B-215ENST00000498054 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 TTC34A8MYJ7 566 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 CLIC1O00299 241 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF213O14771 459 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 SEPT4O43236 478 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 TFRCP02786 760 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 TACR2P21452 398 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 MATN1P21941 496 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 ITPKBP27987 946 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 SLC8A1P32418 973 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 RARRES1P49788 294 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 RCAN1P53805 252 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.642e-7■□□□□ 10.7
POLR1B-215ENST00000498054 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD1Q15327 319 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 CNGA3Q16281 694 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 ESX1Q8N693 406 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 TEX19Q8NA77 164 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 CAGE1Q8TC20 777 aa4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC17Q96LX7 622 aa4.83□□□□□ -1.64
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