RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 CNPY3Q9BT09 278 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 TRIM7Q9C029 511 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM51Q9NW97 253 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.48■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 WDFY4Q6ZS81 3184 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 ANTXRLA6NF34 631 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 GALCP54803 685 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 RABGAP1LQ5R372 815 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.47■□□□□ 0.87
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HLA-B-255ENST00000498007 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGEF26Q96DR7 871 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.47■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.46■□□□□ 0.87
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HLA-B-255ENST00000498007 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 CDH18Q13634 790 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 C2orf27AQ580R0 203 aa20.46■□□□□ 0.87
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HLA-B-255ENST00000498007 FBXL22Q6P050 247 aa20.46■□□□□ 0.87
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HLA-B-255ENST00000498007 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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HLA-B-255ENST00000498007 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.46■□□□□ 0.87
HLA-B-255ENST00000498007 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.46■□□□□ 0.87
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HLA-B-255ENST00000498007 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
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HLA-B-255ENST00000498007 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.45■□□□□ 0.86
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HLA-B-255ENST00000498007 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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HLA-B-255ENST00000498007 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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HLA-B-255ENST00000498007 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.43■□□□□ 0.86
HLA-B-255ENST00000498007 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.43■□□□□ 0.86
HLA-B-255ENST00000498007 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa20.43■□□□□ 0.86
HLA-B-255ENST00000498007 A0A1B0GVM2 712 aa20.42■□□□□ 0.86
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HLA-B-255ENST00000498007 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.42■□□□□ 0.86
HLA-B-255ENST00000498007 E9PAM4 449 aa20.42■□□□□ 0.86
HLA-B-255ENST00000498007 ATG13O75143 517 aa20.42■□□□□ 0.86
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