RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496281.1

RTEL1-TNFRSF6B-204, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,314 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SPASTQ9UBP0 616 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NR5A2O00482 541 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ALOX15BO15296 676 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EPS8Q12929 822 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LY6KQ17RY6 165 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BMT2Q1RMZ1 405 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 OTOAQ7RTW8 1153 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LUZP2Q86TE4 346 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CEP41Q9BYV8 373 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UMODL1Q5DID0 1318 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CRABP2P29373 138 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TKTP29401 623 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ULK2Q8IYT8 1036 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CERKQ8TCT0 537 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FICDQ9BVA6 458 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IMPAD1Q9NX62 359 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VANGL2Q9ULK5 521 aa18.48■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MRASO14807 208 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 UQCRBP14927 111 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DSG3P32926 999 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AADACL2Q6P093 401 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ARPINQ7Z6K5 226 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FNIP1Q8TF40 1166 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CHKAP35790 457 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CDH8P55286 799 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HGSNATQ68CP4 663 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RMND5AQ9H871 391 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TISP43B9A030 160 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CYP3A4P08684 503 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GTF2A2P52657 109 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NME5P56597 212 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CSHL1Q14406 222 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RGS21Q2M5E4 152 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SETD9Q8NE22 299 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ASS1P00966 412 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NPY2RP49146 381 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PIGWQ7Z7B1 504 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RNF180Q86T96 592 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KAT5Q92993 513 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 IDI2Q9BXS1 227 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GSC2O15499 205 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 FLT3P36888 993 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 LHX1P48742 406 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 EFEMP1Q12805 493 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZPBP2Q6X784 338 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 HASPINQ8TF76 798 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TNFRSF25Q93038 417 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM169Q96HH4 297 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TTYH3Q9C0H2 523 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 KCNMB3Q9NPA1 279 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SETD4Q9NVD3 440 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SNTG2Q9NY99 539 aa18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 A0A096LPK6 155 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 CASP5P51878 434 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ZFPM1Q8IX07 1006 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 NSMCE2Q96MF7 247 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ASB2Q96Q27 587 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TMEM245Q9H330 911 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 WDR41Q9HAD4 459 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 RPL14P50914 215 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 ASTN1O14525 1302 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 VPS4BO75351 444 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GJB6O95452 261 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 TPBGLP0DKB5 382 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 GALNTL6Q49A17 601 aa18.46■□□□□ 0.55
RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms