RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SLC5A1P13866 664 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TFEBP19484 476 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TNFSF4P23510 183 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SLC8A1P32418 973 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ME1P48163 572 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 YPEL5P62699 121 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 MAPK7Q13164 816 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 MTA1Q13330 715 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 CSHL1Q14406 222 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SEC23BQ15437 767 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 MAPKAPK3Q16644 382 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TNIP3Q96KP6 325 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TUBB6Q9BUF5 446 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ERVK-5Q9HDB9 667 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 HELLSQ9NRZ9 838 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RGL1Q9NZL6 768 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 KANK1Q14678 1352 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ERVK-7P63135 1459 aa5.39□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 IQGAP1P46940 1657 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 OR2W5A6NFC9 320 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TULP3O75386 442 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RPS6KB1P23443 525 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 GNALP38405 381 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 AK2P54819 239 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 LONRF1Q17RB8 773 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 FAM209BQ5JX69 171 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 FAM57BQ71RH2 274 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 GLMPQ8WWB7 406 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB9Q96C00 473 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 FAR2Q96K12 515 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RASA4BC9J798 803 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PODXLO00592 558 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 APAF1O14727 1248 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RASA4O43374 803 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PRC1O43663 620 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 CBFA2T3O75081 653 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 FGF18O76093 207 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 GLP2RO95838 553 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 MYL3P08590 195 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PRF1P14222 555 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 GABRB3P28472 473 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 THBS4P35443 961 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 HOXD12P35452 270 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 KCNJ4P48050 445 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 BTKQ06187 659 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 PMS2P11Q13670 270 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 P2RY11Q96G91 374 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 CCDC138Q96M89 665 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 NECTIN3Q9NQS3 549 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SLIT1O75093 1534 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.37□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 IKBKBO14920 756 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 OAZ2O95190 189 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 NDST3O95803 873 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ENO1P06733 434 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 AKR1A1P14550 325 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 NDUFS1P28331 727 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ELF2Q15723 593 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ACSM6Q6P461 480 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 ADGRF4Q8IZF3 695 aa5.36□□□□□ -1.55
RBM39-241ENST00000496183 OR2C3Q8N628 320 aa5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms