RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC12A2P55011 1212 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC37A1P57057 533 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFAIP2Q03169 654 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAMB3Q13751 1172 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR93Q6P2C0 686 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM57BQ71RH2 274 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFYVE19Q96K21 471 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WACQ9BTA9 647 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRB3Q9BUF7 120 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MECRQ9BV79 373 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMSYQ7Z589 1322 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF28PB7ZC32 967 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOCS2O14508 198 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP12O75317 370 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP15O95972 392 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP3A4P08684 503 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKR1A1P14550 325 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TFEBP19484 476 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKT1P31749 480 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B4GALNT1Q00973 533 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLE3Q04726 772 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTX1Q13505 466 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZACNQ401N2 412 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD40Q6AI12 368 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHRS13Q6UX07 377 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFPM2Q8WW38 1151 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM2Q9C040 744 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERVK-5Q9HDB9 667 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM45AQ9NWC5 275 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NFU1Q9UMS0 254 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTN6Q9UQ52 1028 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYT5O00445 386 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTN5O94779 1100 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCKBRP32239 447 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINF1P36955 418 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNLIPRP1P54315 467 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAS2R50P59544 299 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FHL1Q13642 323 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PGM5Q15124 567 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMCESQ96FZ2 354 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF347Q96SE7 839 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMOQ9BU70 441 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KATNAL1Q9BW62 490 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB21Q9UL25 225 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC12A4Q9UP95 1085 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC38A8A6NNN8 435 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WNT1P04628 370 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGF2P09038 288 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GYS1P13807 737 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP3A7P24462 503 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHC2P98077 582 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MORC3Q14149 939 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TWIST1Q15672 202 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BTBD16Q32M84 506 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIDNQ504T8 468 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIPMQ5VYY2 423 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KAT2BQ92831 832 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF580Q9UK33 172 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0G2JK05 382 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.7 ms