RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCTN3O75935 186 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZWINTO95229 277 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN7P35236 360 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCK1P35558 622 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NME8Q8N427 588 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM81AQ8TBF8 368 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SMOQ99835 787 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP29Q9HBJ7 922 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNK1O00180 336 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNE1P15382 129 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINB3P29508 390 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GMPRP36959 345 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC7BQ86TV6 843 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BANPQ8N9N5 519 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNYQ8ND76 341 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYT15Q9BQS2 421 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAPN9O14815 690 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP12O75317 370 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNB1P14635 433 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MROH9Q5TGP6 573 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CASC4Q6P4E1 433 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A6NHS1 94 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MFSD11O43934 449 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCAM1P13591 858 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPR3P17342 541 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FCGRTP55899 365 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RIPK1Q13546 671 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CES3Q6UWW8 571 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRYBG2Q8N1P7 616 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM13CQ8NE31 585 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGAP3Q96P47 875 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSPG4P5Q96PW8 444 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COPEO14579 308 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CA12O43570 354 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP1B1Q10567 949 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DERAQ9Y315 318 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GM2AP17900 193 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCND1P24385 295 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARFIP2P53365 341 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF220Q5VTB9 566 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UNC93AQ86WB7 457 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MZB1Q8WU39 189 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUDCD1Q96RS6 583 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP16Q9BY84 665 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPC25Q9HBM1 224 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GDAP2Q9NXN4 497 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KANSL3Q9P2N6 904 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS4O75173 837 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FYNP06241 537 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VAV1P15498 845 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GATMP50440 423 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJA9P57773 515 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TFDP2Q14188 446 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAZQ16635 292 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAF2Q6P1X5 1199 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNIP3Q96KP6 325 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SIK2Q9H0K1 926 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SOAT2O75908 522 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPIN1Q14693 890 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BOLA3Q53S33 107 aa15.96■□□□□ 0.15
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms