RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 SFI1A8K8P3 1242 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 LACTBL1A8MY62 500 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RASA4BC9J798 803 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RASA4O43374 803 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CALUO43852 315 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TLL1O43897 1013 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CA3P07451 260 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PNPLA4P41247 253 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TGFBIQ15582 683 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 IL23RQ5VWK5 629 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 LRRC8BQ6P9F7 803 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ZNF276Q8N554 614 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 URGCPQ8TCY9 931 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 HELQQ8TDG4 1101 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 USP29Q9HBJ7 922 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RASAL2Q9UJF2 1139 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 A0A088AWK7 358 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 FAM187AA6NFU0 413 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NRP1O14786 923 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 C7P10643 843 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TCF3P15923 654 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TAC1P20366 129 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CLCN4P51793 760 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ASIC1P78348 528 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SMARCB1Q12824 385 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ADAM15Q13444 863 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 GRM2Q14416 872 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PPP2R5EQ16537 467 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 FAM171BQ6P995 826 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 DYMQ7RTS9 669 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 FAM186BQ8IYM0 893 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SPERTQ8NA61 448 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 MIPEPQ99797 713 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SAR1AQ9NR31 198 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RIPK2O43353 540 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NR3C1P04150 777 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PCSK6P29122 969 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ATP5DP30049 168 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SLCO1A2P46721 670 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TRIM67Q6ZTA4 783 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 LILRB2Q8N423 598 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PLIN2Q99541 437 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 PITPNM3Q9BZ71 974 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SPG21Q9NZD8 308 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.92□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 AKAP3O75969 853 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 THP07101 528 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 MYOGP15173 224 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CRABP2P29373 138 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ACADVLP49748 655 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 GATMP50440 423 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CDR2Q01850 454 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SPIDRQ14159 915 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 MAN2A1Q16706 1144 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 ACAD11Q709F0 780 aa7.91□□□□□ -1.14
USP4-211ENST00000485450 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
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