RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480447.5

NOP56-212, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 651 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-212ENST00000480447 AFMP43652 599 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 VAMP7P51809 220 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 KIF11P52732 1056 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CACNA2D1P54289 1103 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CDH8P55286 799 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ARID5AQ03989 594 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ZBTB16Q05516 673 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 KDSRQ06136 332 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CCDC142Q17RM4 750 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 EMC10Q5UCC4 262 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 GLRX5Q86SX6 157 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 C12orf40Q86WS4 652 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 DEFB124Q8NES8 71 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 DNASE2BQ8WZ79 361 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 GATA6Q92908 595 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PMEPA1Q969W9 287 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PAGE5Q96GU1 130 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CDC6Q99741 560 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SMOQ99835 787 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TMEM74BQ9NUR3 256 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.369e-6■■□□□ 12.8
NOP56-212ENST00000480447 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 NAGPAQ9UK23 515 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.56□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SLC35F4A4IF30 521 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PATE3B3GLJ2 98 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ST8SIA5O15466 376 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 GREM1O60565 184 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CILPO75339 1184 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SASH3O75995 380 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 VNN1O95497 513 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 LATS1O95835 1130 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TBX18O95935 607 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 IGLV3-19P01714 112 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 THBS1P07996 1170 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CISD3P0C7P0 127 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 IRF1P10914 325 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CES1P23141 567 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ASPAP45381 313 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PTSQ03393 145 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 STK4Q13043 487 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CUL4BQ13620 913 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ENPP2Q13822 863 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 INAVAQ3KP66 663 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 MPP7Q5T2T1 576 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CEP135Q66GS9 1140 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 KRT39Q6A163 491 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 Q6ZNB5 142 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 HSCBQ8IWL3 235 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 CPXM2Q8N436 756 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 C12orf29Q8N999 325 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 GOLGA1Q92805 767 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SKA1Q96BD8 255 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 PLD4Q96BZ4 506 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 GSX2Q9BZM3 304 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
NOP56-212ENST00000480447 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms