RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	PTPN2	P17706	415 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	AMPD1	P23109	780 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	WEE1	P30291	646 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ACTN2	P35609	894 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	KCNJ1	P48048	391 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	DYNLT1	P63172	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SLC7A5	Q01650	507 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SNX1	Q13596	522 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	P3H1	Q32P28	736 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TDH	Q8IZJ6	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	FATE1	Q969F0	183 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SNF8	Q96H20	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	VAT1	Q99536	393 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218		A0A1W2PPC1	479 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	C5orf60	A6NFR6	353 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218		E9PAM4	449 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	FAM72C	H0Y354	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218		H7C0C1	242 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SGK1	O00141	431 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TBX18	O95935	607 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	KRT14	P02533	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TCF3	P15923	654 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	HDC	P19113	662 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	GABRR2	P28476	465 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ATP5O	P48047	213 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MAPKAPK2	P49137	400 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	NDST2	P52849	883 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	GALNT2	Q10471	571 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	DUSP6	Q16828	381 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	FAM72B	Q86X60	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MIB1	Q86YT6	1006 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	HDAC11	Q96DB2	347 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TSGA13	Q96PP4	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PAK5	Q9P286	719 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	NEU3	Q9UQ49	428 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218		F5H5T6	163 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ACSL4	O60488	711 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	GCAT	O75600	419 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	STC2	O76061	302 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	IVD	P26440	423 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	IRS1	P35568	1242 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	ADCY8	P40145	1251 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CLCN6	P51797	869 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	GBE1	Q04446	702 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	CBLB	Q13191	982 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPS18-231	ENST00000472218	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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