RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 COG7P83436 770 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TMPRSS15P98073 1019 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SCAPQ12770 1279 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 STX3Q13277 289 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TRNP1Q6NT89 227 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TAF2Q6P1X5 1199 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 BNIPLQ7Z465 357 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 LINC00523Q86TU6 105 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 C7orf31Q8N865 590 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 C12orf29Q8N999 325 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 STKLD1Q8NE28 680 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FAM13CQ8NE31 585 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 IRGQQ8WZA9 623 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 WNT8BQ93098 351 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SLC2A13Q96QE2 648 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NPY6RQ99463 290 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CPNE1Q99829 537 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CNGB3Q9NQW8 809 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DTLQ9NZJ0 730 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 BFARQ9NZS9 450 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SLC17A7Q9P2U7 560 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GGT7Q9UJ14 662 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.76□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 A0A0G2JND7 137 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 HAS3O00219 553 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GSC2O15499 205 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 BANF1O75531 89 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RECQL4O94761 1208 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MPOP05164 745 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SERPINA6P08185 405 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RARBP10826 455 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NPR3P17342 541 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SULT1E1P49888 294 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RAP1GDS1P52306 607 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ADAM17P78536 824 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 OCRLQ01968 901 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 GAD2Q05329 585 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ASPHQ12797 758 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ORC1Q13415 861 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PRPSAP1Q14558 356 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 E2F5Q15329 346 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KIZQ2M2Z5 673 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 RSPH3Q86UC2 560 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KIRREL3Q8IZU9 778 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ARMC5Q96C12 935 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.017e-17■■□□□ 14.4
ACTB-208ENST00000464611 AP5M1Q9H0R1 490 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 KCNK13Q9HB14 408 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SPC25Q9HBM1 224 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SETD4Q9NVD3 440 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 DONSONQ9NYP3 566 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 ZNF212Q9UDV6 495 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 USP3Q9Y6I4 520 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 WDR91A4D1P6 747 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-208ENST00000464611 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa8.74□□□□□ -1.01
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