RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 CDO1Q16878 200 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 VITQ6UXI7 678 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ARCQ7LC44 396 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 GLMNQ92990 594 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF34Q969K3 372 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 NT5C3BQ969T7 300 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINB11Q96P15 392 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 DDIT4Q9NX09 232 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 NUMBLQ9Y6R0 609 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.75□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 IRAK2O43187 625 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ECI2O75521 394 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV3-25P01717 112 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 KLKB1P03952 638 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ASGR2P07307 311 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 PTPN9P43378 593 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ZP2Q05996 745 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF77Q15935 545 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 MTSS1LQ765P7 747 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOT2Q8IXI1 618 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 RFFLQ8WZ73 363 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC39A13Q96H72 371 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 CNPY3Q9BT09 278 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 KCNK12Q9HB15 430 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 PIGVQ9NUD9 493 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 OBP2AQ9NY56 170 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 RRN3Q9NYV6 651 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.74□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 MYO1FO00160 1098 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 PJA2O43164 708 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 BUB1O43683 1085 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 GREM1O60565 184 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 MTA2O94776 668 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 ENDOD1O94919 500 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 F9P00740 461 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV3-27P01718 113 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC175P0C221 793 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TCF3P15923 654 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 CXCR3P49682 368 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 HDAC4P56524 1084 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 KIF5AQ12840 1032 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 MESDQ14696 234 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TCEAL1Q15170 157 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM68Q6AZZ1 485 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 HTR3DQ70Z44 454 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 STRADAQ7RTN6 431 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 BNIPLQ7Z465 357 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM131BQ86XD5 332 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 DENND1CQ8IV53 801 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 YAF2Q8IY57 180 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC8Q8TAM2 541 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 FNIP1Q8TF40 1166 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD28-208ENST00000463533 E2F7Q96AV8 911 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms