RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBC1D4O60343 1298 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP7B1O75881 506 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALDH1A2O94788 518 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KNG1P01042 644 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AHSGP02765 367 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PROCP04070 461 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD1AP06126 327 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXKP42681 527 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD97P48960 835 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STAT5BP51692 787 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHB4P54760 987 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PKP1Q13835 747 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLCB4Q15147 1175 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CALCRLQ16602 461 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC44A4Q53GD3 710 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC14AQ86T13 490 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIRREL1Q96J84 757 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AZI2Q9H6S1 392 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF302Q9NR11 478 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DACT1Q9NYF0 836 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MROH7Q68CQ1 1323 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EMSYQ7Z589 1322 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLCA1A8K7I4 914 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYT5O00445 386 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BTN3A1O00481 513 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NPC1O15118 1278 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITGA10O75578 1167 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INSRRP14616 1297 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCSK1P29120 753 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKCEQ02156 737 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP4A11Q02928 519 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC13A2Q13183 592 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RTP5Q14D33 572 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HYIQ5T013 277 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAML1Q92585 1016 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TOX2Q96NM4 488 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTMR9Q96QG7 549 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIT2Q99578 217 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIPK3Q9H422 1215 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RGL1Q9NZL6 768 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRFN1Q9P244 771 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MTMR6Q9Y217 621 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LTBP2Q14767 1821 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SZT2Q5T011 3432 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 J3KRW8 73 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IRAK2O43187 625 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MATN4O95460 622 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIMP1P01033 207 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT-ND5P03915 603 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GYPEP15421 78 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSF2RAP15509 400 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HDCP19113 662 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VIPR1P32241 457 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THPOP40225 353 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNJ5P48544 419 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RESTQ13127 1097 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 POSTNQ15063 836 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MARCH8Q5T0T0 291 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms