RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DKK3Q9UBP4 350 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STK39Q9UEW8 545 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A087WZ62 844 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf81A6NN90 581 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F8W735 103 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AGRPO00253 132 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF623O75123 536 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRIG2O94898 1065 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPA4LO95757 839 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP17A1P05093 508 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EPHX1P07099 455 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 THEGLP0DJG4 465 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXA9P31269 272 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLH1P40692 756 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCR2P41597 374 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPTX2P47972 431 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCNN1GP51170 649 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IRX4P78413 519 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DSC1Q08554 894 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BLMHQ13867 455 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PON2Q15165 354 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEC23AQ15436 765 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAF12Q16514 161 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INF2Q27J81 1249 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBXN11Q5T124 520 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HASPINQ8TF76 798 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC6Q99741 560 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VPS11Q9H270 941 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLMPQ9H6B4 373 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LY9Q9HBG7 655 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HPF1Q9NWY4 346 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIOSQ9NXC5 875 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GDE1Q9NZC3 331 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INVSQ9Y283 1065 aa6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FLNCQ14315 2725 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR27A2RRH5 827 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM150BA6NC51 233 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKAP3O75969 853 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT38O76015 456 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APBB3O95704 486 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1RP00736 705 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MT-ND3P03897 115 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCP11498 1178 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMC3P17980 439 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCKDHBP21953 392 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GRIK1P39086 918 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEPHS1P49903 392 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RCAN1P53805 252 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBXN1Q04323 297 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC16Q13042 620 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PSMD5Q16401 504 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP41Q3LFD5 358 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC38Q502W7 563 aa6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms