RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 FAM81BQ96LP2 452 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MIS12Q9H081 205 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 LHX5Q9H2C1 402 aa21.8■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 H0Y626 953 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TBL1XO60907 577 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM16O95361 564 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 CALCAP01258 141 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MAOBP27338 520 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 CD70P32970 193 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MFN1Q8IWA4 741 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SCUBE3Q8IX30 993 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TTC17Q96AE7 1141 aa21.79■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 KRT5P13647 590 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM110Q86TL2 294 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 KDM1BQ8NB78 822 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 OR2I1PQ8NGU4 316 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ST7Q9NRC1 585 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SUN2Q9UH99 717 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.78■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 PCNX2A6NKB5 2137 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ASLP04424 464 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 C1QTNF9P0C862 333 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF883P0CG24 379 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ARID5BQ14865 1188 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 TAC4Q86UU9 113 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 CACUL1Q86Y37 369 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 GATA6Q92908 595 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 MYO19Q96H55 970 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 OSGEPQ9NPF4 335 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa21.77■■□□□ 1.08
LIMS1-208ENST00000428064 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV3-25P01717 112 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 GNA15P30679 374 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 RPS14P62263 151 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF366Q8N895 744 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MED15Q96RN5 788 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SCML1Q9UN30 329 aa21.76■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SPEGQ15772 3267 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 FAM221BA6H8Z2 402 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CAPN9O14815 690 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CER1O95813 267 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 DNTTP04053 509 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SPINK2P20155 84 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ACSL1P33121 698 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CDH18Q13634 790 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 NAXDQ8IW45 347 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 THAP9Q9H5L6 903 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SGK2Q9HBY8 427 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 MSRB2Q9Y3D2 182 aa21.75■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 E5RJQ4 531 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 THAP12O43422 761 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 SH3BP5O60239 455 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 APOEP02649 317 aa21.74■■□□□ 1.07
LIMS1-208ENST00000428064 CSKP41240 450 aa21.74■■□□□ 1.07
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