RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427193.1

C9orf3-205, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 704 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-205ENST00000427193 RHOP08100 348 aa6.22□□□□□ -1.41
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C9orf3-205ENST00000427193 PPP2R5BQ15173 497 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF425Q6IV72 752 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 IQCA1Q86XH1 822 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 GTF3C6Q969F1 213 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 HOOK2Q96ED9 719 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
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C9orf3-205ENST00000427193 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.22□□□□□ -1.41
C9orf3-205ENST00000427193 TMX2Q9Y320 296 aa6.22□□□□□ -1.41
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C9orf3-205ENST00000427193 TSPY3P0CV98 308 aa6.21□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 TSPY8P0CW00 308 aa6.21□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 NR2F6P10588 404 aa6.21□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.21□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 C12orf42Q96LP6 360 aa6.21□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.21□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 ACER1Q8TDN7 264 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.2□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa6.2□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 PDHXO00330 501 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 CYTH3O43739 400 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 NXPH3O95157 252 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 ARIH2O95376 493 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
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C9orf3-205ENST00000427193 ITGALP20701 1170 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 BACE1P56817 501 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 DSC2Q02487 901 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 ICA1Q05084 483 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 ZNF543Q08ER8 600 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf3-205ENST00000427193 TCF15Q12870 199 aa6.19□□□□□ -1.42
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