RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.61□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.61□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MAGEB3O15480 346 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CDH6P55285 790 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DGCR6Q14129 220 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC25A23Q9BV35 468 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 V9GYQ6 96 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 USP6P35125 1406 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 UBDO15205 165 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ITM2AO43736 263 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RXRGP48443 463 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CASP4P49662 377 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SEPHS1P49903 392 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ENTPD1P49961 510 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ECT2LQ008S8 904 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NAB1Q13506 487 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CYP51A1Q16850 503 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM83EQ2M2I3 478 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DSTYKQ6XUX3 929 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TDRPQ86YL5 185 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF560Q96MR9 790 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF696Q9H7X3 374 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 IFT52Q9Y366 437 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PHKA1P46020 1223 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AP3B2Q13367 1082 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 XKR9Q5GH70 373 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 MYDGFQ969H8 173 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NEK6Q9HC98 313 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DHRS12A0PJE2 317 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ABATP80404 500 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SPERTQ8NA61 448 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMIEQ8NEW7 156 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PHF12Q96QT6 1004 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LTN1O94822 1766 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 RBL1P28749 1068 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GNA12Q03113 381 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CHSY1Q86X52 802 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DSELQ8IZU8 1212 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FETUBQ9UGM5 382 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 NUP50Q9UKX7 468 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 H7C0S8 307 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TMBIM6P55061 237 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ARPP19P56211 112 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HSF2Q03933 536 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PLET1Q6UQ28 207 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PJA1Q8NG27 643 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ATL1Q8WXF7 558 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 K7EPI3 171 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SLC22A2O15244 555 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CSPG5O95196 566 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CD4P01730 458 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.352e-8■■■■■ 39.2
SBNO1-202ENST00000420886 MCEEQ96PE7 176 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DNAJC18Q9H819 358 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF222Q9UK12 451 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 LAMB1P07942 1786 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 GRM4Q14833 912 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 AGKQ53H12 422 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAR1Q8WVX9 515 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 FAM20AQ96MK3 541 aa6.6□□□□□ -1.35
SBNO1-202ENST00000420886 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.6□□□□□ -1.35
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