RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 GOLGA1Q92805 767 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CHODLQ9H9P2 273 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM160Q9NX00 188 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 KCND3Q9UK17 655 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DERAQ9Y315 318 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 H7C1Q1 480 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 M0QYT0 321 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 NKX2-8O15522 239 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ALADP13716 330 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CREB1P16220 341 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 XBP1P17861 261 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ADRA1DP25100 572 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PTGER1P34995 402 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 THBS4P35443 961 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TUBP50607 506 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 VAMP2P63027 116 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MPP1Q00013 466 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CHRNDQ07001 517 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 LMOD3Q0VAK6 560 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 BFSP2Q13515 415 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DNASE1L3Q13609 305 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SLC12A1Q13621 1099 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 AAK1Q2M2I8 961 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CEP78Q5JTW2 689 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 RASGRP2Q7LDG7 609 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SLC2A12Q8TD20 617 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 NPIPB3Q92617 1050 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 HTRA1Q92743 480 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SKA1Q96BD8 255 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 VPS50Q96JG6 964 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ASB2Q96Q27 587 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MACROD1Q9BQ69 325 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 UNC45AQ9H3U1 944 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 NOD2Q9HC29 1040 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 LMTK3Q96Q04 1460 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 A6NLC8 198 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 AP4M1O00189 453 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CA12O43570 354 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TMPRSS11DO60235 418 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 EXOC3O60645 756 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TNFAIP3P21580 790 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 MMP8P22894 467 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 LIFRP42702 1097 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DIO1P49895 249 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PSG6Q00889 435 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PDCLQ13371 301 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TRPC3Q13507 836 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DCTN1Q14203 1278 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DLGAP5Q15398 846 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 FAM187BQ17R55 369 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF569Q5MCW4 686 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 ACSM6Q6P461 480 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 C16orf89Q6UX73 402 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 HEATR4Q86WZ0 1026 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 CHSY1Q86X52 802 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 P3H2Q8IVL5 708 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 GALNT4Q8N4A0 578 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 TERB1Q8NA31 727 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 USP38Q8NB14 1042 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-207ENST00000418674 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
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