RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 PDHXO00330 501 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CXCL11O14625 94 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF213O14771 459 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 NMT2O60551 498 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TSPY3P0CV98 308 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TSPY8P0CW00 308 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 EEF2P13639 858 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PDCP20941 246 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TM4SF4P48230 202 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TFAP4Q01664 338 aa5.05□□□□□ -1.6
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PTPRK-209ENST00000415046 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 DTX2Q86UW9 622 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TICAM2Q86XR7 235 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 FAM167AQ96KS9 214 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC17Q96LX7 622 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 NELL2Q99435 816 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CPA4Q9UI42 421 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CTNNA3Q9UI47 895 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 A0A1W2PRG0 241 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PPM1DO15297 605 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CA12O43570 354 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 JTBO76095 146 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PDHA1P08559 390 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TYRP14679 529 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 NDUFB7P17568 137 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CCND1P24385 295 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 MAP2K6P52564 334 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF134P52741 427 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 BACE1P56817 501 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 MTX3Q5HYI7 312 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM240Q5SV17 173 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 USP45Q70EL2 814 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 RASGRP2Q7LDG7 609 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 MAVSQ7Z434 540 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CPA6Q8N4T0 437 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SH2D4AQ9H788 454 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 HESX1Q9UBX0 185 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CLIP2Q9UDT6 1046 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ANAPC4Q9UJX5 808 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 STX8Q9UNK0 236 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF236Q9UL36 1845 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PLIN4Q96Q06 1357 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 C19orf81C9J6K1 198 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 E7EWF7 191 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 H0YIZ8 118 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TLR5O60602 858 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 AHSGP02765 367 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CYP21A2P08686 494 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 PRR35P0CG20 571 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 VCAM1P19320 739 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC96Q2M329 555 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 EMC10Q5UCC4 262 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF626Q68DY1 528 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 STOX1Q6ZVD7 989 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 CYB5R4Q7L1T6 521 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 NEK8Q86SG6 692 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-209ENST00000415046 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa5.03□□□□□ -1.6
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