RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 AFMIDQ63HM1 303 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ANKRD40Q6AI12 368 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NFRKBQ6P4R8 1299 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MED25Q71SY5 747 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RRAGAQ7L523 313 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MAATS1Q7Z4T9 603 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 HOOK3Q86VS8 718 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NLRP14Q86W24 1093 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 USP38Q8NB14 1042 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 OR56A1Q8NGH5 318 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC26Q8TAB7 109 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCHCR1Q8TD31 782 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SDR42E1Q8WUS8 393 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 KAT2BQ92831 832 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ACAP3Q96P50 834 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZIM3Q96PE6 472 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TTC1Q99614 292 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ANKRD2Q9GZV1 360 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LDAHQ9H6V9 325 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM114A2Q9NRY5 505 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RNF181Q9P0P0 153 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ASAP1Q9ULH1 1129 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MYO3BQ8WXR4 1341 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 A0A1B0GUA9 196 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GMNCA6NCL1 334 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CFAP73A6NFT4 308 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ENPP3O14638 875 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PHF2O75151 1096 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ULK1O75385 1050 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RASSF9O75901 435 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CAMTA2O94983 1202 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NTSR2O95665 410 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 BAG3O95817 575 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CFIP05156 583 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 HLA-DOAP06340 250 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LDHCP07864 332 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 HKR1P10072 659 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 EZRP15311 586 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FPR1P21462 350 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 LMO1P25800 156 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NF2P35240 595 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRKCIP41743 596 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC1A4P43007 532 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 NAPAP54920 295 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SESN3P58005 492 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 C21orf58P58505 322 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 EVA1CP58658 441 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 GUCY2DQ02846 1103 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 MECOMQ03112 1051 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TAP1Q03518 808 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 OCA2Q04671 838 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SCAPQ12770 1279 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 STK4Q13043 487 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 PDCLQ13371 301 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 XRCC4Q13426 336 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RIPK1Q13546 671 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ITIH4Q14624 930 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 RPS6KA1Q15418 735 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SNCBQ16143 134 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADRM1Q16186 407 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ASIC2Q16515 512 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TXNRD1Q16881 649 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 ASPRV1Q53RT3 343 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC10A5Q5PT55 438 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 HYIQ5T013 277 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 WLSQ5T9L3 541 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 C12orf60Q5U649 245 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 SUSD4Q5VX71 490 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRT79Q5XKE5 535 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms