RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 NUP62CLQ9H1M0 184 aa12.86□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TMEM245Q9H330 911 aa12.86□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 ADAMTS20P59510 1910 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TULP2O00295 520 aa12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 CD27P26842 260 aa12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 STX17P56962 302 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CUL2Q13617 745 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 COL28A1Q2UY09 1125 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 DPCR1Q3MIW9 517 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 TATDN2Q93075 761 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 BIRC7Q96CA5 298 aa12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 ABCC13Q9NSE7 274 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 DKK4Q9UBT3 224 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP12.84□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 RAXQ9Y2V3 346 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 LAMA5O15230 3695 aa12.84□□□□□ -0.35
PRAME-204ENST00000403441 PTPRBP23467 1997 aa12.83□□□□□ -0.35
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PRAME-204ENST00000403441 E7ENQ6 273 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-204ENST00000403441 DKK1O94907 266 aa12.83□□□□□ -0.36
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PRAME-204ENST00000403441 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 C21orf59P57076 290 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 ST8SIA6P61647 398 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 RPS14P62263 151 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 PTPRNQ16849 979 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 CCDC40Q4G0X9 1142 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 MPP7Q5T2T1 576 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 NUGGCQ68CJ6 796 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 MBLAC2Q68D91 279 aa12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PRAME-204ENST00000403441 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.83□□□□□ -0.36
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