RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 BDNFP23560 247 aa8.32□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 CSRP3P50461 194 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 HECTD3Q5T447 861 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 DPH6Q7L8W6 267 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 MARCH9Q86YJ5 346 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.32□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 C8orf76Q96K31 380 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 BBS2Q9BXC9 721 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.32□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.32□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa8.31□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.31□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 NCKAP1LP55160 1127 aa8.31□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 TAF10Q12962 218 aa8.31□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 RTP5Q14D33 572 aa8.31□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 KIF19Q2TAC6 998 aa8.31□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 CTSBP07858 339 aa8.3□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 NUP93Q8N1F7 819 aa8.3□□□□□ -1.08
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CASP4-201ENST00000393150 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.3□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 MED8Q96G25 268 aa8.3□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CASP4-201ENST00000393150 C8orf48Q96LL4 319 aa8.3□□□□□ -1.08
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