RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389589.8

SHOX2-201, Transcript of short stature homeobox 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHOX2, Length 2,072 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOX2-201ENST00000389589 RASA4O43374 803 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 GSTA2P09210 222 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 MAGEA3P43357 314 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TRABD2AQ86V40 505 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SPPL2BQ8TCT7 592 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CASP10Q92851 521 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SERPINB11Q96P15 392 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PGLYRP2Q96PD5 576 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 RABEP2Q9H5N1 569 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CCDC134Q9H6E4 229 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 NMUR1Q9HB89 426 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 IL37Q9NZH6 218 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 AVILO75366 819 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 GPR17Q13304 367 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 MTM1Q13496 603 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PARP6Q2NL67 630 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.94■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CPB1P15086 417 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 GALNT2Q10471 571 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 WASHC5Q12768 1159 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ANKS3Q6ZW76 656 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 HDAC11Q96DB2 347 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SNX10Q9Y5X0 201 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SHROOM3Q8TF72 1996 aa25.93■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TBC1D4O60343 1298 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 MLNP12872 115 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 STX2P32856 288 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 FAM182AQ5T1J6 154 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ADGRD1Q6QNK2 874 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ATAD1Q8NBU5 361 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SEPT10Q9P0V9 454 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CREB1P16220 341 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 KRT15P19012 456 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 MSH2P43246 934 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CCT5P48643 541 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 GPR15P49685 360 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PGFP49763 221 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TLE2Q04725 743 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF567Q8N184 647 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 NPWQ8N729 165 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 B3GALT6Q96L58 329 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PAFAH2Q99487 392 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TTPALQ9BTX7 342 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 COMMD8Q9NX08 183 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 HCSTQ9UBK5 93 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.92■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 FAM92AA1XBS5 289 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF534Q76KX8 674 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 NETO2Q8NC67 525 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 MTMR11A4FU01 709 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PAGE1O75459 146 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SLC2A3P11169 496 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ARPP19P56211 112 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 COG7P83436 770 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 ZNF33AQ06730 810 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TRIM60Q495X7 471 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 DEFB128Q7Z7B8 93 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CHMP6Q96FZ7 201 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SPATA17Q96L03 361 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TLR6Q9Y2C9 796 aa25.91■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 EBAG9O00559 213 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CPP00450 1065 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 YWHAQP27348 245 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 HOXC13P31276 330 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 GARSP41250 739 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 PSEN1P49768 467 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 RTP2Q5QGT7 225 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TP53INP2Q8IXH6 220 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 VAT1Q99536 393 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 SIK2Q9H0K1 926 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 TRABDQ9H4I3 376 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 OSER1Q9NX31 292 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.9■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 KCNU1A8MYU2 1149 aa25.89■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 FOXO6A8MYZ6 492 aa25.89■■□□□ 1.74
SHOX2-201ENST00000389589 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms