RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 UBL4BQ8N7F7 174 aa30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ASIC4Q96FT7 647 aa30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ASB2Q96Q27 587 aa30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 OSBPL2Q9H1P3 480 aa30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 OR12D3Q9UGF7 316 aa30.57■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC66A2RUB6 948 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PSTPIP1O43586 416 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ZP2Q05996 745 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CHSY1Q86X52 802 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 FAM217AQ8IXS0 508 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 KRT35Q92764 455 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 NXPE3Q969Y0 559 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf74Q96LT6 269 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL11Q9NVR0 708 aa30.56■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 KCNK3O14649 394 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF185O15231 689 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 IFNAR2P48551 515 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 MARCKSL1P49006 195 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 VCPP55072 806 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM68Q6AZZ1 485 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 RFWD3Q6PCD5 774 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 OTUB2Q96DC9 234 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CARD9Q9H257 536 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 IGSF9Q9P2J2 1179 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB8A8MWE9 144 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 FAM72CH0Y354 149 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ASGR2P07307 311 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 BMP1P13497 986 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 TACR2P21452 398 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CXCR5P32302 372 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CHKAP35790 457 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 AUHQ13825 339 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 FAM72AQ5TYM5 149 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 FAM72DQ6L9T8 149 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 FAM72BQ86X60 149 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 FAM83CQ9BQN1 747 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 VANGL2Q9ULK5 521 aa30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 GDI1P31150 447 aa30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 EML3Q32P44 896 aa30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 C14orf80Q86SX3 495 aa30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CPXM2Q8N436 756 aa30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PSMB7Q99436 277 aa30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa30.54■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 MYO10Q9HD67 2058 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CTAGE15A4D2H0 777 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 F5H5T6 163 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 TSPAN3O60637 253 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CTAGE8P0CG41 777 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 L1CAMP32004 1257 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PAFAH1B1P43034 410 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 DPYSL2Q16555 572 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 FBXL22Q6P050 247 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CTAGE6Q86UF2 777 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CTAGE4Q8IX94 777 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 LGI2Q8N0V4 545 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 MYEOVQ96EZ4 313 aa30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CHADO15335 359 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CREB3O43889 395 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PEX5P50542 639 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PDGFRLQ15198 375 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC181Q5TID7 509 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 SLC44A3Q8N4M1 653 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 KCTD6Q8NC69 237 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CAPZA3Q96KX2 299 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 EBF3Q9H4W6 596 aa30.52■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
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ECHS1-201ENST00000368547 UQCRHLA0A096LP55 91 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 E9PAM4 449 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 UQCRHP07919 91 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ARSAP15289 507 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 CDH6P55285 790 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 SEMA3BQ13214 749 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 TPGS1Q6ZTW0 290 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF683Q8IZ20 524 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 RASGEF1CQ8N431 466 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 ACTRT1Q8TDG2 376 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 MYOFQ9NZM1 2061 aa30.51■■■□□ 2.48
ECHS1-201ENST00000368547 GFRA2O00451 464 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 LRIG2O94898 1065 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 KRT1P04264 644 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 DNA2P51530 1060 aa30.51■■■□□ 2.47
ECHS1-201ENST00000368547 TNK2Q07912 1038 aa30.51■■■□□ 2.47
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