RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.09■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 PTPRFP10586 1907 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 MFSD11O43934 449 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 MYL4P12829 197 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SULT1E1P49888 294 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 PDK1Q15118 436 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GRIK4Q16099 956 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 GSTA3Q16772 222 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.08■■□□□ 1.13
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX25Q9H3E2 840 aa22.08■■□□□ 1.13
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PTDSS1-201ENST00000337004 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 TTC1Q99614 292 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 GINS2Q9Y248 185 aa22.07■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGAP42A6NI28 874 aa22.07■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 PROCP04070 461 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 MX2P20592 715 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 GP5P40197 560 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 COPAP53621 1224 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 KIZQ2M2Z5 673 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 AAGABQ6PD74 315 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 VTA1Q9NP79 307 aa22.07■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 NME8Q8N427 588 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.06■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ERVK-10P10266 1014 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 POTEAQ6S8J7 498 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 TSC22D3Q99576 134 aa22.05■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
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PTDSS1-201ENST00000337004 ERFP50548 548 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 CACNA2D1P54289 1103 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 DCAF6Q58WW2 860 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 NOTUMQ6P988 496 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.05■■□□□ 1.12
PTDSS1-201ENST00000337004 CEP41Q9BYV8 373 aa22.05■■□□□ 1.12
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