RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.99■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CD101Q93033 1021 aa20.99■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.99■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.99■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.99■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 URODP06132 367 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 DNAJB2P25686 324 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 OR1D2P34982 312 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SCN4BQ8IWT1 228 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 LINC01553A4QN01 128 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ATP5HO75947 161 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ARHGEF15O94989 841 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SCNN1AP37088 669 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 GPR15P49685 360 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 KRT17Q04695 432 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 MPP2Q14168 576 aa20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CEP290O15078 2479 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 C2CD4BA6NLJ0 364 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CREB3O43889 395 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 RARGP13631 454 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 PSMA2P25787 234 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 MAN1A1P33908 653 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SLC1A1P43005 524 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 MAGEA11P43364 429 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC6Q16204 474 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SPRED2Q7Z698 418 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 USTQ9Y2C2 406 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ACSL3O95573 720 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 GSTA2P09210 222 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CTNNB1P35222 781 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC8CQ8TDW0 803 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ART4Q93070 314 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ZBP1Q9H171 429 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SOAT2O75908 522 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 BRAFP15056 766 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 BMPR1AP36894 532 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINB4P48594 390 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 DAOAP59103 153 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SMARCB1Q12824 385 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 DDR2Q16832 855 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CCNJLQ8IV13 435 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 STKLD1Q8NE28 680 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF10BO14763 440 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO21O94952 628 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L7P0C7H9 530 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 GPD1P21695 349 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SLC5A3P53794 718 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 GBP5Q96PP8 586 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 OCEL1Q9H607 264 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2B-201ENST00000265339 TCF4P15884 667 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 PDGFRAP16234 1089 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 VHLP40337 213 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R40P59535 323 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 C8orf48Q96LL4 319 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 CFAP57Q96MR6 1250 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC37BQ96QE4 947 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 DCLRE1BQ9H816 532 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 STOML1Q9UBI4 398 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ZBED1O96006 694 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 GSTT1P30711 240 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP4Q13115 394 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2B-201ENST00000265339 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms