RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 USP24Q9UPU5 2620 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 FYNP06241 537 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 SLC6A4P31645 630 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 GRIK2Q13002 908 aa21.87■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 FAM124AQ86V42 546 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 MFN1Q8IWA4 741 aa21.87■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 DNTTP04053 509 aa21.86■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.86■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.85■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A5Q9BY07 1137 aa21.85■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF883P0CG24 379 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 NAXDQ8IW45 347 aa21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 SNX19Q92543 992 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 SCML1Q9UN30 329 aa21.83■■□□□ 1.09
NEDD8-201ENST00000250495 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.83■■□□□ 1.09
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NEDD8-201ENST00000250495 MOCS3O95396 460 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA4FO95754 770 aa21.82■■□□□ 1.08
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NEDD8-201ENST00000250495 CSKP41240 450 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 MATKP42679 507 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 CDH18Q13634 790 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 KDM1BQ8NB78 822 aa21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-201ENST00000250495 THAP9Q9H5L6 903 aa21.82■■□□□ 1.08
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