RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ALOX15BO15296 676 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 NEBLO76041 1014 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 GCAP28676 217 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 MAMLD1Q13495 774 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A12Q504Y0 691 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 DPH6Q7L8W6 267 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PCGF5Q86SE9 256 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SMRP1Q8NCR6 262 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A14Q8TBB6 771 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 STK32AQ8WU08 396 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PARVAQ9NVD7 372 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGXB4Q9UGU5 601 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM33Q9UPN9 1127 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf16Q68DN1 1984 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 LLGL1Q15334 1064 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 FYB2Q5VWT5 728 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM47EQ6ZV65 393 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPUQ71F23 418 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 THEM5Q8N1Q8 247 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM86AQ8N2M4 240 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6B3Q8NGW1 331 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBPHLA2RUH7 354 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6C75A6NL08 312 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SOAT2O75908 522 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT15P19012 456 aa27.18■■□□□ 1.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPR17Q13304 367 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF11Q15544 211 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ALLCQ8N6M5 410 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4F11Q9HBI6 524 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CD207Q9UJ71 328 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF37A1IGU5 675 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXO6A8MYZ6 492 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 C8AP07357 584 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 WARSP23381 471 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP4Q13115 394 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 HHATQ5VTY9 493 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf82Q8WW14 230 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PWWP2AQ96N64 755 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PKMYT1Q99640 499 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR11A4FU01 709 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R40P59535 323 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 NOMO3P69849 1222 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 LEXMQ3ZCV2 418 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 CNTN6Q9UQ52 1028 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TYROBPO43914 113 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 IL9P15248 144 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PHBP35232 272 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX1P48742 406 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CYLDQ9NQC7 956 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC28Q96AY4 2481 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SMAPO00193 183 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 MBTPS2O43462 519 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CA4P22748 312 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TWNKQ96RR1 684 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 BCO2Q9BYV7 579 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 IMPG2Q9BZV3 1241 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF148Q9UQR1 794 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIOO75962 3097 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL16O15467 120 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PEX11AO75192 247 aa27.15■■□□□ 1.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 TSHRP16473 764 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CD58P19256 250 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN4P29074 926 aa27.15■■□□□ 1.94
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CAPNS1-201ENST00000246533 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 LMNTD2Q8IXW0 634 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC2Q8NEN0 867 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDL1Q96EA4 605 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 NIF3L1Q9GZT8 377 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX25Q9H3E2 840 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH9Q9HC56 1237 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC189A1A4V9 331 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 SRGAP2BP0DMP2 458 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-201ENST00000246533 ARSEP51690 589 aa27.14■■□□□ 1.94
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