RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638372.1

SCARB2-208, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5

Gene SCARB2, Length 4,811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-208ENST00000638372 THRAP10827 490 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 NPR3P17342 541 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 CALB2P22676 271 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 CD151P48509 253 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 APOPT1Q96IL0 206 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 EFCAB1Q9HAE3 211 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 PRR23AA6NEV1 266 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 FCHO1O14526 889 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 YWHAQP27348 245 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 PSMB4P28070 264 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 CYGBQ8WWM9 190 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 YY1AP1Q9H869 796 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 VHLP40337 213 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 PTK2BQ14289 1009 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 PTPN20Q4JDL3 420 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 BBS12Q6ZW61 710 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 CNDP1Q96KN2 507 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 KANSL3Q9P2N6 904 aa14.71□□□□□ -0.05
SCARB2-208ENST00000638372 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CLDN5O00501 218 aa14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CLPBQ9H078 707 aa14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 C2CD2Q9Y426 696 aa14.71□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 RRM2BQ7LG56 351 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 HELQQ8TDG4 1101 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 HSFY1Q96LI6 401 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 SERPINB11Q96P15 392 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 GPR20Q99678 358 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 UBXN6Q9BZV1 441 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MRGBPQ9NV56 204 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MMP8P22894 467 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TAGAPQ8N103 731 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MREGQ8N565 214 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CCDC126Q96EE4 140 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ZNF333Q96JL9 665 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 OLFM3Q96PB7 478 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NID2Q14112 1375 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TRIM13O60858 407 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CRTAMO95727 393 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ALLCQ8N6M5 410 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ANKRD52Q8NB46 1076 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 LGMNQ99538 433 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ECSITQ9BQ95 431 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CIPCQ9C0C6 399 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PTPRHQ9HD43 1115 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.7□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 MAGEB16A2A368 324 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 RBP1P09455 135 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PGAM1P18669 254 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 PTPN4P29074 926 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 SLC1A6P48664 564 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 HDAC4P56524 1084 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 COG5Q9UP83 839 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 EGFRP00533 1210 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 KRT16P08779 473 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ATP6V1B1P15313 513 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 GOT1P17174 413 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 ITGB6P18564 788 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TNFRSF8P28908 595 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 IQCKQ8N0W5 287 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 RNF148Q8N7C7 305 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 LZICQ8WZA0 190 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 AAASQ9NRG9 546 aa14.69□□□□□ -0.06
SCARB2-208ENST00000638372 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms