RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	TTC36	A6NLP5	189 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	FGFR1	P11362	822 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	ETS1	P14921	441 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	CPA2	P48052	419 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	NRIP1	P48552	1158 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	SPATA20	Q8TB22	786 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		14.71	□□□□□ -0.05
NEDD4L-238	ENST00000635997	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997		H0YGN5	161 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM153B	P0C7A2	387 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PRLR	P16471	622 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MMRN1	Q13201	1228 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM153C	Q494X1	144 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	NPNT	Q6UXI9	565 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		14.71	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	NCKAP1L	P55160	1127 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LAYN	Q6UX15	382 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	BTAF1	O14981	1849 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PSMD3	O43242	534 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITGB6	P18564	788 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LSP1	P33241	339 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GRIK3	Q13003	919 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CFAP99	D6REC4	459 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06	3e-6	■■■■□ 19.6
NEDD4L-238	ENST00000635997	NDUFS2	O75306	463 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDHA1	P08559	390 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ELK3	P41970	407 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	ARL4D	P49703	201 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MAMLD1	Q13495	774 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CUL3	Q13618	768 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06	3e-6	■■■■□ 20.7
NEDD4L-238	ENST00000635997	USP6NL	Q92738	828 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		14.7	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	DGKI	O75912	1065 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SUPT7L	O94864	414 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TRIM16	O95361	564 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LYPLA2	O95372	231 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	NPR3	P17342	541 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	TUSC3	Q13454	348 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GTF2H3	Q13889	308 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MFSD5	Q6N075	450 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	SERPINI1	Q99574	410 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	STK39	Q9UEW8	545 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CA3	P07451	260 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	GEM	P55040	296 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06	1e-6	■■□□□ 13.3
NEDD4L-238	ENST00000635997	CHI3L2	Q15782	390 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	HYI	Q5T013	277 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	CREG2	Q8IUH2	290 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		14.69	□□□□□ -0.06
NEDD4L-238	ENST00000635997	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		14.69	□□□□□ -0.06

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