RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620182.4

CPEB1-218, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CPEB1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-218ENST00000620182 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 RAD54BQ9Y620 910 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 FAM159BA6NKW6 160 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 RNF103O00237 685 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NRP1O14786 923 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ETV4P43268 484 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SERPINB9P50453 376 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SCNN1GP51170 649 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SCAPQ12770 1279 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 DPYSQ14117 519 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SNCBQ16143 134 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CCNJLQ8IV13 435 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF276Q8N554 614 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CCNYQ8ND76 341 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 KLHL29Q96CT2 875 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 LRRC37BQ96QE4 947 aa21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ATP5HO75947 161 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 RAB27AP51159 221 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 PARP6Q2NL67 630 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 LRRC8BQ6P9F7 803 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 FAM111AQ96PZ2 611 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 E7ENQ6 273 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MGRN1O60291 552 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 PGK1P00558 417 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 FYNP06241 537 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MGAT3Q09327 533 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 C10orf82Q8WW14 230 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa21.79■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 DCLK1O15075 740 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 F9P00740 461 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 LTFP02788 710 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ODC1P11926 461 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NEFHP12036 1026 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NCAM1P13591 858 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 HCAR3P49019 387 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 UPP1Q16831 310 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MPP5Q8N3R9 675 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MKS1Q9NXB0 559 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CNTFP26441 200 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 FLT3LGP49771 235 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MNAT1P51948 309 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 METTL23Q86XA0 190 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 KCNK16Q96T55 309 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SMYD2Q9NRG4 433 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.78■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NCAM2O15394 837 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 USP17L7P0C7H9 530 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CCNB1P14635 433 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 GRIA1P42261 906 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TPI1P60174 286 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 PRKCZQ05513 592 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 STEAP4Q687X5 459 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TTC17Q96AE7 1141 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NAT9Q9BTE0 207 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 MOCS1Q9NZB8 636 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 SEPT10Q9P0V9 454 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ZNF623O75123 536 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 UNC5CO95185 931 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CSH1P0DML2 217 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CSH2P0DML3 217 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 PAX3P23760 479 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CCNFP41002 786 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 NKX3-2P78367 333 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TRIM42Q8IWZ5 723 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 ERP27Q96DN0 273 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 TSSK1BQ9BXA7 367 aa21.77■■□□□ 1.08
CPEB1-218ENST00000620182 CHKBQ9Y259 395 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms