RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619804.1

CPS1-212, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CPS1, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-212ENST00000619804 FAM170AA1A519 330 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 LCHNA4D1U4 455 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 TTLL8A6PVC2 850 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 ZNF487B1APH4 448 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 H3BRJ5 948 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 KRIT1O00522 736 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 TGM5O43548 720 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 LRCH4O75427 683 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 ENDOD1O94919 500 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 FGGP02679 453 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 C8AP07357 584 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RARGP13631 454 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 MIPP30301 263 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CDH6P55285 790 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RING1Q06587 406 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 TWF1Q12792 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 NME3Q13232 169 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 PPP2R5DQ14738 602 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RNF217Q8TC41 542 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 GIPC2Q8TF65 315 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CASP10Q92851 521 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 NT5C3BQ969T7 300 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 NTAN1Q96AB6 310 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 TIFAQ96CG3 184 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CALN1Q9BXU9 219 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 PBX4Q9BYU1 374 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 DCLK3Q9C098 648 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 MYO9BQ13459 2157 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 A0A1W2PQH9 124 aa6.5□□□□□ -1.37
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CPS1-212ENST00000619804 NCAM2O15394 837 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 TLR5O60602 858 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 GAS8O95995 478 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 POU2F2P09086 479 aa6.5□□□□□ -1.37
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CPS1-212ENST00000619804 CHRNA3P32297 505 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CXCR5P32302 372 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 PTPN7P35236 360 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 SERPINB6P35237 376 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 SLC11A2P49281 568 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RGS19P49795 217 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 PEX5P50542 639 aa6.5□□□□□ -1.37
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CPS1-212ENST00000619804 TBX4P57082 545 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 ERVFC1P60507 584 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 AMPD2Q01433 879 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 LILRA6Q6PI73 481 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.5□□□□□ -1.37
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CPS1-212ENST00000619804 HSPH1Q92598 858 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 EDEM1Q92611 657 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CD101Q93033 1021 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 PLD4Q96BZ4 506 aa6.5□□□□□ -1.37
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CPS1-212ENST00000619804 ZNF670Q9BS34 389 aa6.5□□□□□ -1.37
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CPS1-212ENST00000619804 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-212ENST00000619804 YY1AP1Q9H869 796 aa6.5□□□□□ -1.37
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