RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 KIF3AQ9Y496 699 aa9.28□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 RAD54BQ9Y620 910 aa9.28□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PTPRBP23467 1997 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PRRT4C9JH25 899 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 H3BQV1 296 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GREM1O60565 184 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ZNF217O75362 1048 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ALX3O95076 343 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TNNC2P02585 160 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 IRF1P10914 325 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GAP43P17677 238 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 YWHAQP27348 245 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 COX20Q5RI15 118 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CHPFQ8IZ52 775 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 KCNK16Q96T55 309 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GABRG3Q99928 467 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ELOVL4Q9GZR5 314 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MUC3BQ9H195 1237 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SNX25Q9H3E2 840 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 IL21RQ9HBE5 538 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 KNL1Q8NG31 2342 aa9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FRMD3A2A2Y4 597 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 WASH3PC4AMC7 463 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TACC1O75410 805 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 IDEP14735 1019 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PGFP49763 221 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BNC1Q01954 994 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SETDB1Q15047 1291 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 HECTD3Q5T447 861 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 Q6ZS46 218 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GLRX5Q86SX6 157 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NUP93Q8N1F7 819 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 P2RY11Q96G91 374 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CRELD1Q96HD1 420 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GMIPQ9P107 970 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ZNF233A6NK53 670 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 MEI4A8MW99 385 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 A8MXQ7 604 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 CACNG3O60359 315 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 NDUFS2O75306 463 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BMP15O95972 392 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TYRP14679 529 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 GNSP15586 552 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 HOXD13P35453 343 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TUBP50607 506 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SLC5A3P53794 718 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 ALCAMQ13740 583 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TPGS1Q6ZTW0 290 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 SV2BQ7L1I2 683 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 WDR49Q8IV35 697 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.25□□□□□ -0.93
TTR-204ENST00000610404 HPS3Q969F9 1004 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms