RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF40O75150 1001 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPNS1P04632 268 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 GBP1P32455 592 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEA1P43355 309 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 DAOAP59103 153 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 XYLT1Q86Y38 959 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA1Q92805 767 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO32Q969P5 355 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-214ENST00000592483 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GABBR2O75899 941 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 APBB3O95704 486 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM253P0C7T8 217 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 IRX4P78413 519 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 MTF1Q14872 753 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 C19orf48Q6RUI8 117 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GAREM2Q75VX8 874 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 C11orf74Q86VG3 221 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 MON1AQ86VX9 555 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 C3orf20Q8ND61 904 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SCINQ9Y6U3 715 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PATE3B3GLJ2 98 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC25CP30307 473 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GALCP54803 685 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 USP46P62068 366 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A3Q01959 620 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 HS1BP3Q53T59 392 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR158Q5T848 1215 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PMS2CLQ68D20 193 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 BEND5Q7L4P6 421 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT13Q7L8C5 426 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ARCQ7LC44 396 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SCUBE3Q8IX30 993 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF653Q96CK0 615 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GCNAQ96QF7 691 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNF1Q9H3M0 494 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ATXN3LQ9H3M9 355 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PARVAQ9NVD7 372 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PRAMEF12O95522 483 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 EGFP01133 1207 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 USP17L7P0C7H9 530 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TAF10Q12962 218 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM83CQ9BQN1 747 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GKN1Q9NS71 199 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CLIC5Q9NZA1 410 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ZMYM5Q9UJ78 669 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 MAST4O15021 2626 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 H0Y626 953 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 HSF2BPO75031 334 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM16O95361 564 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP1A2P05177 515 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 DRD1P21728 446 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 VAV2P52735 878 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 AMPD2Q01433 879 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 LMAN2Q12907 356 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXO43Q4G163 708 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF276Q8N554 614 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CHFRQ96EP1 664 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TASP1Q9H6P5 420 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TJP2Q9UDY2 1190 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PIK3R2O00459 728 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC175P0C221 793 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PFKLP17858 780 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCB4P21439 1286 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 RRM1P23921 792 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBP50607 506 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 RUNX3Q13761 415 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TCEAL1Q15170 157 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 STKLD1Q8NE28 680 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 THAP2Q9H0W7 228 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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