RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HSF2BP	O75031	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBED4	O75132	1171 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	STAM2	O75886	525 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NOL4	O94818	638 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CFB	P00751	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ICAM1	P05362	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	UCHL3	P15374	230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PON1	P27169	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GTF2H1	P32780	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HSD17B4	P51659	736 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	JAK3	P52333	1124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	OAZ1	P54368	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	VSNL1	P62760	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC32	Q14392	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TCEA2	Q15560	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	USH1G	Q495M9	461 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PNKP	Q96T60	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MNT	Q99583	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PFAS	O15067	1338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF263	O14978	683 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOC3	O60645	756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MOCS3	O95396	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GGPS1	O95749	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	F2	P00734	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GZMA	P12544	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPN2	P17655	700 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ACTN2	P35609	894 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SOX5	P35711	763 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	FMO5	P49326	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	KLK7	P49862	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMC5	P62195	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	PEX26	Q7Z412	305 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPRM-215	ENST00000583289	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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