RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC35A4	Q96G79	324 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DPH1	Q9BZG8	443 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZWILCH	Q9H900	591 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	STAP2	Q9UGK3	403 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	VPS28	Q9UK41	221 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	C19orf81	C9J6K1	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS44	E7EML9	344 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CLGN	O14967	610 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	OAZ2	O95190	189 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	A1BG	P04217	495 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ADRB2	P07550	413 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PDHA1	P08559	390 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAI3	P08754	354 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EBLN1	P0CF75	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NR2F1	P10589	423 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MYL4	P12829	197 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SCG2	P13521	617 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TYR	P14679	529 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BRAF	P15056	766 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V1B1	P15313	513 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ITGAL	P20701	1170 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MUT	P22033	750 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PHKA1	P46020	1223 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CCT8	P50990	548 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR5	P51681	352 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GNAI1	P63096	354 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ACVR2B	Q13705	512 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	BMPR2	Q13873	1038 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT32	Q14532	448 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PLS1	Q14651	629 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB30	Q15771	203 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	EMC10	Q5UCC4	262 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LIN54	Q6MZP7	749 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	NGEF	Q8N5V2	710 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM136A	Q96C01	138 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	RADIL	Q96JH8	1075 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA17	Q96L03	361 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPY26P	Q9H489	355 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	WDCP	Q9H6R7	721 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	COL20A1	Q9P218	1284 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM64B	A6NI03	449 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC36	A6NLP5	189 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BUI4	141 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PODXL	O00592	558 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	DCLK1	O15075	740 aa		3.09	□□□□□ -1.91
AKAP13-223	ENST00000560957	PPM1D	O15297	605 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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