RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CYP21A2	P08686	494 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF1A	P19438	455 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	PLCD1	P51178	756 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	DGKE	P52429	567 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TCP10	Q12799	353 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	MYO1E	Q12965	1108 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	E2F2	Q14209	437 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SLC29A2	Q14542	456 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CTR9	Q6PD62	1173 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	RNF44	Q7L0R7	432 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TEX11	Q8IYF3	940 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934		Q8N1X5	172 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	OR2C3	Q8N628	320 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	FAM136A	Q96C01	138 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	IQCD	Q96DY2	449 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SGCZ	Q96LD1	299 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	NAPB	Q9H115	298 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	COL4A3	Q01955	1670 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	GLTPD2	A6NH11	291 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF213	O14771	459 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ERBB2	P04626	1255 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CPA1	P15085	419 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ADORA2A	P29274	412 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	LRPAP1	P30533	357 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TDO2	P48775	406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAG1	P54619	331 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SATB1	Q01826	763 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	BIRC2	Q13490	618 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	PMS2P11	Q13670	270 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF7	Q14155	803 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SBK1	Q52WX2	424 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf60	Q5U649	245 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	DLK2	Q6UY11	383 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF627	Q7L945	461 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	YAF2	Q8IY57	180 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	PMM1	Q92871	262 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1191	Q96A73	305 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	IDI2	Q9BXS1	227 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SERHL	Q9NQF3	203 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	DMTF1	Q9Y222	760 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINS1-210	ENST00000560934	SBF1	O95248	1867 aa		5.09	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	FLT1	P17948	1338 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934	AK9	Q5TCS8	1911 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LINS1-210	ENST00000560934		E7EWF7	191 aa		5.08	□□□□□ -1.6

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