RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558963.2

AC087516.2-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC087516.2, Length 3,042 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC087516.2-201ENST00000558963 KRT81Q14533 505 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 KCTD2Q14681 263 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SEZ6Q53EL9 994 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RNF220Q5VTB9 566 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 MBLAC2Q68D91 279 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 EMC1Q8N766 993 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PHC3Q8NDX5 983 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 RDH11Q8TC12 318 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 JADE3Q92613 823 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 TRIM4Q9C037 500 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PIDD1Q9HB75 910 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 VPS28Q9UK41 221 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 FZD10Q9ULW2 581 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 PTPRDP23468 1912 aa6.65□□□□□ -1.34
AC087516.2-201ENST00000558963 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 TMEM114B3SHH9 223 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 KCNN4O15554 427 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CACNG3O60359 315 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 BANF1O75531 89 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 GABBR2O75899 941 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 KLHL2O95198 593 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 MYL2P10916 166 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CYP2F1P24903 491 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 RAP1GAPP47736 663 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 SP4Q02446 784 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 SEMA3BQ13214 749 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CCDC153Q494R4 210 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 C6orf163Q5TEZ5 329 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ACAD11Q709F0 780 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 TMEM192Q8IY95 271 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 NME8Q8N427 588 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 HSPH1Q92598 858 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 DPF3Q92784 378 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ECSITQ9BQ95 431 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CALN1Q9BXU9 219 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 RNF39Q9H2S5 420 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.65□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 H7C0C1 242 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 STRNO43815 780 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CAPNS1P04632 268 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 INSRRP14616 1297 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 RBL1P28749 1068 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 HOXC8P31273 242 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CPOXP36551 454 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 MATKP42679 507 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ATP5OP48047 213 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ZBTB16Q05516 673 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 BST1Q10588 318 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 OVGP1Q12889 678 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CUL3Q13618 768 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 DPYSQ14117 519 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 TAF5Q15542 800 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ZNF394Q53GI3 561 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 PMF1Q6P1K2 205 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 SLC27A1Q6PCB7 646 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CLEC14AQ86T13 490 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 BEST2Q8NFU1 509 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 CNDP1Q96KN2 507 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 ZNF560Q96MR9 790 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 FAM111AQ96PZ2 611 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 PANX3Q96QZ0 392 aa6.64□□□□□ -1.35
AC087516.2-201ENST00000558963 VAT1Q99536 393 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms