RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554534.5

PCNX4-208, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-208ENST00000554534 FTSJ1Q9UET6 329 aa7□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 USP3Q9Y6I4 520 aa7□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ATMQ13315 3056 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 A0A1W2PP55 124 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 FAM170AA1A519 330 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 TTC34A8MYJ7 566 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 E7ENQ6 273 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ENC1O14682 589 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 MID1O15344 667 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 FLRT2O43155 660 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 TNFSF14O43557 240 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ABCB7O75027 752 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 SDC3O75056 442 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 SIN3BO75182 1162 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 GABBR2O75899 941 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 DKK1O94907 266 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 DNTTP04053 509 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CYBBP04839 570 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 P4HA1P13674 534 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 VAV1P15498 845 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 SLC6A4P31645 630 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CHKAP35790 457 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CTSKP43235 329 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ABCG1P45844 678 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 RAD23BP54727 409 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 GALCP54803 685 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 C21orf59P57076 290 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 COG7P83436 770 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PDE4CQ08493 712 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ADIGQ0VDE8 80 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 KCNJ12Q14500 433 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 FSCBQ5H9T9 825 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 RESP18Q5W5W9 173 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 KLK6Q92876 244 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CDC6Q99741 560 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 MYOCQ99972 504 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 TMEM245Q9H330 911 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 EXOC1Q9NV70 894 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 FBXL12Q9NXK8 326 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 GGA2Q9UJY4 613 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.99□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PPP6R2O75170 966 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ZBED1O96006 694 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 IGLV3-19P01714 112 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 RPN1P04843 607 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ITGAVP06756 1048 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF883P0CG24 379 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CD19P15391 556 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 ABCB4P21439 1286 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CD27P26842 260 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 GRK6P43250 576 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PSMD8P48556 350 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 CCT8P50990 548 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 AP3M2P53677 418 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 INCA1Q0VD86 236 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 TEAD4Q15561 434 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 MPPE1Q53F39 396 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 HES3Q5TGS1 186 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.98□□□□□ -1.29
PCNX4-208ENST00000554534 PCSK4Q6UW60 755 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms