RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 ESYT3A0FGR9 886 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 O00370 1275 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 ZNF623O75123 536 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 TRIM16O95361 564 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 POLBP06746 335 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 MATKP42679 507 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 MMP13P45452 471 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 STAT4Q14765 748 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 BRD3Q15059 726 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 FAM187BQ17R55 369 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 SHC3Q92529 594 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 SEMA4DQ92854 862 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 TDP1Q9NUW8 608 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 NUP188Q5SRE5 1749 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 MGEA5O60502 916 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 FAAP100Q0VG06 881 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 USP45Q70EL2 814 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 VSIG1Q86XK7 387 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 DYNC1I1O14576 645 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 COPEO14579 308 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 RNF40O75150 1001 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 RFPL2O75678 378 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 RHOBTB1O94844 696 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 MSH3P20585 1137 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 HALP42357 657 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 EPHB4P54760 987 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 TEAD2Q15562 447 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 ACTL9Q8TC94 416 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 HLA-CQ95604 372 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 MS4A14Q96JA4 679 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 EPC1Q9H2F5 836 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.15□□□□□ -1.1
SENP1-210ENST00000552189 GRM6O15303 877 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 TEX28O15482 410 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 TIE1P35590 1138 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 HADHAP40939 763 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 GPR17Q13304 367 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 KRT222Q8N1A0 295 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 SUN2Q9UH99 717 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.15□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 RFXAPO00287 272 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 PPEF2O14830 753 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 CLDN11O75508 207 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 FSBPO95073 299 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 ADSSP30520 456 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 LIG3P49916 1009 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 CAP1Q01518 475 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 MMEL1Q495T6 779 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 KCTD16Q68DU8 428 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 SPATA20Q8TB22 786 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 CACNA1GO43497 2377 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 PAGE1O75459 146 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 MTA2O94776 668 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 TMCC1O94876 653 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 FDFT1P37268 417 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 PRKAA1Q13131 559 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 CUL1Q13616 776 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 PDGFRLQ15198 375 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 INSCQ1MX18 579 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SENP1-210ENST00000552189 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.14□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms