RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MYO6Q9UM54 1294 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.83□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 E5RJQ4 531 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 H0Y626 953 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 K7EQS6 105 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINC1P01008 464 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CALB1P05937 261 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TPM1P09493 284 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 GNSP15586 552 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NOS2P35228 1153 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF165P49910 485 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZXDBP98169 803 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB16Q05516 673 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TYRO3Q06418 890 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LMAN2Q12907 356 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 IL31Q6EBC2 164 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ANO7Q6IWH7 933 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 KDM1BQ8NB78 822 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 HMGB4Q8WW32 186 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SKA1Q96BD8 255 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC114Q96M63 670 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 HHIPQ96QV1 700 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NUP58Q9BVL2 599 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 VPS45Q9NRW7 570 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FANCLQ9NW38 375 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 OSER1Q9NX31 292 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ELOVL2Q9NXB9 296 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 STOML2Q9UJZ1 356 aa5.82□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 SHISA7A6NL88 538 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 LGALS16A8MUM7 142 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 F8VZ95 297 aa5.81□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 TBL1XO60907 577 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 CLDN11O75508 207 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHX1P07099 455 aa5.81□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 C1QTNF9P0C862 333 aa5.81□□□□□ -1.48
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CLSTN3-215ENST00000544584 FERP16591 822 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX5P35711 763 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 ETFBP38117 255 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 MATKP42679 507 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC6A11P48066 632 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT83P78385 493 aa5.81□□□□□ -1.48
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