RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 GBE1Q04446 702 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT88Q13099 833 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MPP2Q14168 576 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 OTUD6BQ8N6M0 293 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 TOP1MTQ969P6 601 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.94■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 RAG1P15918 1043 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 DAOAP59103 153 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CBLBQ13191 982 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 BNIPLQ7Z465 357 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.93■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 M0QYT0 321 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 GCATO75600 419 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 FYNP06241 537 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L7P0C7H9 530 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 GOT1P17174 413 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 RTP2Q5QGT7 225 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNT2Q6UVM3 1135 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 FBF1Q8TES7 1133 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SGSM3Q96HU1 749 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 TRABDQ9H4I3 376 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CHMP2BQ9UQN3 213 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 USP3Q9Y6I4 520 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 E7ENQ6 273 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 EFEMP2O95967 443 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 AMPD1P23109 780 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 STX2P32856 288 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ELK3P41970 407 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEA6P43360 314 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 DEUP1Q05D60 604 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MTM1Q13496 603 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM117BQ6P1L5 589 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SMC6Q96SB8 1091 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.92■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 H3BRJ5 948 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPN9O14815 690 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SPAG6O75602 509 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MCOLN1Q9GZU1 580 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MLXIPLQ9NP71 852 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 DTLQ9NZJ0 730 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 HACD1B0YJ81 288 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM66O15016 1216 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 TBC1D4O60343 1298 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC18A1P54219 525 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 NME3Q13232 169 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 VPS52Q8N1B4 723 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CYTH2Q99418 400 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 DHRS4Q9BTZ2 278 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 COX16Q9P0S2 106 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 TCP11X1B4DZS4 312 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.942e-6■■□□□ 13.7
PACSIN3-211ENST00000539589 APRTP07741 180 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MSH2P43246 934 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 MAGEA9P43362 315 aa20.9■□□□□ 0.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.2 ms