RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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PTPRK-222ENST00000532751 CAPN11Q9UMQ6 739 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.77■■□□□ 1.24
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PTPRK-222ENST00000532751 TDGF1P13385 188 aa22.76■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 PTP4A2Q12974 167 aa22.76■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 MS4A13Q5J8X5 152 aa22.76■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.76■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 TRIM14Q14142 442 aa22.75■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 EMC10Q5UCC4 262 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 RAP1GAP2Q684P5 730 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 MON1BQ7L1V2 547 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.75■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 NELL1Q92832 810 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 TBCBQ99426 244 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 WDCPQ9H6R7 721 aa22.75■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 SKILP12757 684 aa22.74■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 SDC4P31431 198 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 SGSHP51688 502 aa22.74■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 EMC1Q8N766 993 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.74■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 CFAP57Q96MR6 1250 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 PIGVQ9NUD9 493 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 STIM2Q9P246 746 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 R4GN57 208 aa22.74■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 GYPCP04921 128 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 GZMAP12544 262 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 PDGFRAP16234 1089 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 CASP14P31944 242 aa22.73■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.73■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.73■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD62A6NC57 917 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 ANTXRLA6NF34 631 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 PROB1E7EW31 1015 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 SERPING1P05155 500 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 TPM1P09493 284 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 CRY1Q16526 586 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 GEN1Q17RS7 908 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 RNF43Q68DV7 783 aa22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTPRK-222ENST00000532751 TRNP1Q6NT89 227 aa22.72■■□□□ 1.23
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