RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 GAREM2Q75VX8 874 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TMC8Q8IU68 726 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SIK2Q9H0K1 926 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ASB3Q9Y575 518 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 DYNC1I1O14576 645 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CCL16O15467 120 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 IGLV3-27P01718 113 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 LRG1P02750 347 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXA9P31269 272 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 FNTAP49354 379 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 DR1Q01658 176 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 DPYSQ14117 519 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 COL19A1Q14993 1142 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC35B2Q8TB61 432 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 HAPLN3Q96S86 360 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 STIM2Q9P246 746 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 RAB21Q9UL25 225 aa22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3-209ENST00000532457 ESYT3A0FGR9 886 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 APOC2P02655 101 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNQ1P51787 676 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 TFDP2Q14188 446 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 RFX8Q6ZV50 586 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 C14orf80Q86SX3 495 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 ITIH5Q86UX2 942 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 NETO2Q8NC67 525 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 PPM1EQ8WY54 764 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC22A12Q96S37 553 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 HOMER3Q9NSC5 361 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 APOL1O14791 398 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 LINC01565O15544 149 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 LRIG2O94898 1065 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP3K6O95382 1288 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 GLP2RO95838 553 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 ARL4AP40617 200 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 GUCY2DQ02846 1103 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 JAMLQ86YT9 394 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 ELMOD1Q8N336 334 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD7Q92527 254 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 GKN1Q9NS71 199 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 NEU3Q9UQ49 428 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 HS3ST4Q9Y661 456 aa22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 H3BRJ5 948 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 GBE1Q04446 702 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 NNTQ13423 1086 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 ATL2Q8NHH9 583 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 XYLBO75191 536 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 MYBL2P10244 700 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP3CCP48454 512 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 HCAR3P49019 387 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 TXNDC8Q6A555 127 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 WDR93Q6P2C0 686 aa22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.68■■□□□ 1.22
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